上海市高層次人才住房補貼需要交個人所得稅。超過國家或地方政府規(guī)定的比例繳付的住房公積金、醫(yī)療保險金、基本養(yǎng)老保險金，應將其超過部分并入個人當期的工資、薪金收入，計征個人所得稅。

《中華人民共和國稅收征收管理法實施細則》

第三十三條納稅人、扣繳義務人的納稅申報或者代扣代繳、代收代繳稅款報告表的主要內容包括：稅種、稅目，應納稅項目或者應代扣代繳、代收代繳稅款項目，計稅依據(jù)，扣除項目及標準，適用稅率或者單位稅額，應退稅項目及稅額、應減免稅項目及稅額，應納稅額或者應代扣代繳、代收代繳稅額，稅款所屬期限、延期繳納稅款、欠稅、滯納金等。

第三十九條稅務機關應當將各種稅收的稅款、滯納金、罰款，按照國家規(guī)定的預算科目和預算級次及時繳入國庫，稅務機關不得占壓、挪用、截留，不得繳入國庫以外或者國家規(guī)定的稅款賬戶以外的任何賬戶。已繳入國庫的稅款、滯納金、罰款，任何單位和個人不得擅自變更預算科目和預算級次。